강화선원사지는 1976년 동국대학교 강화도학술팀이 강화도 일대 표층조사를 하다가 처음 발견됐다. 선원사는 1977년 사적 제259호로 지정되었다. 선원사는 항쟁 중에 강화도로 천도한 직후인 1245년(고려 고종 32)에 최우 장군이 창건한 절이다. 몽골의 침략에 반대합니다.

이 사원은 몽골과의 전쟁에서 영적인 중심지로 여겨졌습니다. 송광사와 함께 우리나라 2대 사찰 중 하나였습니다. 그러나 조선 초기에 사찰은 완전히 파괴되고 유적지만 남았다. 현재 합천 해인사에 소장되어 있는 유명한 팔만대장경 목판은 원래 선원사에 보관되어 있었다고 한다. 목판은 조선시대 선원사에서 흥천사로 옮겨졌다가 세조 때 다시 해인사로 옮겨진 것으로 추정된다.

산비탈에 위치한 건물 부지 추정 위치는 남북으로 250m, 동서로 170m에 이른다.