기존 주주가 아닌 제3자에게 신주인주권을 배정하는 것을 말한다. 신주발행시 기본적으로는 기존 주주의 지분율대로 우선적으로 배정해야 하나, 특별법 또는 주주총회의 특별결의, 현물출자, 출자전환 등에 의해 주주가 아닌 제3자에게 신주인수권을 배정할 수 있다. 

제3자배정은 발행절차가 주주배정, 일반공모 방식 등에 비해 상대적으로 간편하고 비용, 소요기간 등이 상대적으로 적어 자금조달이 용이하다는 장점이 있다. 하지만 부실 기업들이 증권시장에서 퇴출당하는 것을 임시적으로 피하거나, 경영권 인수자금 조달의 수단으로 사용하는 문제점이 많이 발생되기도 한다.